La Autoridad Nacional de Control del Ministerio Público tiene a su cargo el control funcional de los fiscales de todos los niveles y del personal de la función fiscal del Ministerio Público; con excepción de los Fiscales Supremos, cuya competencia es de la Junta Nacional de Justicia.

El control funcional comprende la prevención, supervisión, inspección, investigación, instauración del procedimiento administrativo disciplinario e imposición de la sanción conforme a la Ley N° 30483, Ley de la Carrera Fiscal y otras normas reglamentarias que le sean aplicables para el cumplimiento eficaz de la función.